Скопируйте папку /opt/infrax/data в /opt/infrax_data_bak
Удалите папку /opt/infrax (предварительно остановив контейнеры)
Установите приложение заново (для linux есть скрипт установки https://docs.infrax.ru/pages/02-installation.html#linux-auto-install)
Перед запуском приложения скопируйте папку /opt/infrax_data_bak в /opt/infrax/ и переименуйте в “data”
Вероятно, по какой-то причине, повреждено содержимое папки “.git”